Informations générales
Présentation de l'entité pour diffusion interne
Notre tractus intestinal est colonisé par une communauté complexe de micro-organismes, appelée microbiote, qui joue de nombreux rôles bénéfiques. Cependant, un microbiote non contrôlé peut avoir des effets néfastes sur son hôte en favorisant l'inflammation intestinale
chronique et les maladies associées. Dans notre laboratoire, nous étudions comment le microbiote intestinal est régulé par des facteurs environnementaux, tels que les additifs alimentaires, et comment l'hôte et son microbiote communiquent. Nous explorons également
des voies innovantes pour moduler de manière bénéfique le microbiote intestinal afin de favoriser la santé.
Description du poste
Métier
Autres domaines Ingénierie de la recherche - Ingénieur de recherche
Intitulé du poste
Ingénieur de recherche - H/F
Missions/Activités
Dans le cadre des projets de recherche propre à l'équipe, mais aussi en lien avec les collaborations que nous avons établies, l'ingénieur aura pour mission :
- Les analyses compositionnelles et fonctionnelles des échantillons de microbiote (modèles pré-cliniques souris et microbiote in vitro, mais aussi échantillons humains dans le cadre de plusieurs protocoles de recherche clinique).
- La réception des échantillons, listing, biobanking, préparation des librairies et séquençage, analyse bio-informatique des données obtenus (à la fois en analyse d'amplicon 16S mais aussi en analyse Illumina shotgun métagénomique).
L'ingénieur devra également prendre en charge les analyses fonctionnelles des échantillons mentionnés ci-dessus – analyse du pouvoir pro-inflammatoire en modèle de microbiote in vitro, quantification de certains métabolites et anticorps par ELISA.
En lien avec les projets pré-cliniques de l'équipe, l'ingénieur recruté sera impliqué dans le suivi des expérimentations animales réalisées (manipulation sur souris, gavage et collection d'échantillons de sang et de selles, collections d'organes, et analyses des échantillons ainsi collectés par approches histologiques et moléculaires).
L'ingénieur devra par exemple pouvoir construire une librairie pour séquençage RNA-Seq avec les analyses bio-informatiques adéquates associées.
En lien avec notre modèle de microbiote in vitro permettant de reproduire en tube des microbiotes intestinaux humains, l'ingénieur devra avoir les compétences en microbiologie afin de réaliser des expérimentations indépendantes sur ce système innovant, après formation par les membres actuels du laboratoire.
En plus de participer à l'unicité du laboratoire, une gestion du matériel, des commandes, ainsi que de l'organisation du laboratoire est attendue.
Profil
Titulaire d'un Bac+5, vous avez acquis de l'expérience en Microbiologie, biologie moléculaire, bioinformatique, biologie cellulaire, et experimentation animale.
Notre équipe étant composée d'un seul chercheur statutaire, il sera demandé à l'ingénieur de jouer un rôle central dans la gestion quotidienne de l'équipe, et ceci en étroite collaboration avec le PI. Il est ainsi attendu un sens du travail d'équipe, d'autonomie et d'adaptation.
Temps de travail
Temps plein
Critères candidat
Niveau d'années d'expérience souhaitée
3 à 5 ans
Niveau d'étude souhaité
Bac + 5
Certification ou habilitation requise
Aucune
Localisation du poste
Localisation du poste
France, Paris
Lieu
Paris 15ème - Métro Pasteur
Demandeur
Nom du responsable d'entité
Chassaing
Prénom du responsable d'entité
Benoit
Poste à pourvoir le
01/10/2024
Suivi par
Responsable principal
Nathalie SANSON
Nom
SANSON
Prénom
Nathalie
Email
nathalie.sanson@pasteur.fr
Téléphone
0176535221
