Informations générales
Présentation de l'entité pour diffusion interne
The Bioinformatics and Biostatistics Hub led by Laurent Essioux and Hervé Ménager is part of the Technology Department. It is a platform providing a strong support in Bioinformatics and Biostatistics to the campus.
Description du poste
Métier
Bio info / biostat - Ingénieur de recherche confirmé (Bio info / biostat)
Intitulé du poste
Bioinformaticien.ne (H/F) - Analyse de données OMICS H/F
Missions/Activités
Dans le cadre d'un projet PEPR (Programmes et Equipements Prioritaires de Recherche) visant à comprendre la pathogénèse des virus hémorragiques, le Hub recrute un·e ingénieur·e de recherche en bioinformatique et biostatistique, pour l'analyse des données du projet pour un CDD de 20 mois.
Le projet COPAFLICT a pour objectif d'améliorer les connaissances fondamentales sur les fièvres hémorragiques virales et offrir de nouvelles perspectives pour leur diagnostic et leur traitement. Pour ce faire, il étudiera l'immunopathogénèse associée au virus de la fièvre Lassa (fièvre hémorragique foudroyante), pour identifier les voies immunitaires d'intérêt pour le développement de nouvelles stratégies thérapeutiques ciblant la réponse de l'hôte.
Les 2 missions principales du poste sont :
1. Prendre en charge l'analyse bioinformatique et statistique des données quantitatives issues de séquençage à haut débit (transcriptomiques, protéomiques) et données cliniques générées par les collaborateurs du projet PEPR.
Dans ce contexte, la personne recrutée sera amenée à :
• Développer une approche d'analyse reproductible implémentée en R ;
• Interagir (principalement à distance) directement avec les collaborateurs du projet, basés à Lyon (~ 1 déplacement par an)
• Rédiger des articles scientifiques à l'issue du projet
2. Collaborer sur des projets d'analyse soumis au Hub de Bioinformatique et Biostatistique.
Ces 2 missions prendront plusieurs formes :
• Conseiller et guider dans l'utilisation de méthodes et outils d'analyse existants ;
• Maintenir une veille bibliographique active et évaluer les outils et méthodes publiés ; Intérêt pour les nouvelles pratiques méthodologiques, nouveaux outils et l'analyse de nouveaux types de données
• Analyser les données des collaborateurs et leur exposer les conclusions ;
• Développer lorsque nécessaire des méthodes et outils d'analyse nouveaux.
Profil
Compétences essentielles :
• La maîtrise des outils statistiques pouvant s'adapter aux données de grandes dimensions est indispensable (analyses uni-/multivariées, inférence, modélisation statistique, méthodes linéaires/non-linéaires, regroupement/clustering, apprentissage statistique, etc.)
• Très bonne maîtrise de R
Compétences appréciées :
L'ingénieur·e ayant vocation à analyser des données en partie issues de méthodes de séquençage récentes, les connaissances suivantes constituent des atouts :
• Maîtrise des outils et méthodes classiques d'analyse de données NGS (contrôle de qualité, assemblage, alignement, quantification, expression différentielle, recherche de variants, etc.) ;
• Expérience ou bonne connaissance de l'analyse de tout autre type de données en lien avec la biologie ;
• Connaissance des processus de planification expérimentale (dont les analyses de puissance, identification des facteurs de confusion, etc.) ;
• Connaissance de Python ;
• Expérience en conduite de projet de recherche.
Qualités attendues :
• Sens du travail en équipe
• Goût pour le travail en collaboration
• Rigueur et méthode
• Force de proposition et prise d'initiative
• Adaptabilité et flexibilité
• Qualités relationnelles
• Motivation à se former sur de nouvelles méthodes
• Autonomie
• Goût pour les activités de service, sens de l'implication
• Capacité à travailler au sein d'équipes pluridisciplinaires
Profil :
• Doctorat ou Master ou équivalent en statistiques, bioinformatique, mathématiques appliquées ou dans un domaine connexe
• Expérience professionnelle souhaitée dans la recherche ou le soutien à la recherche en biostatistique, bioinformatique ou analyse de données biologiques
Le Hub et l'Institut Pasteur s'engagent à promouvoir la parité, toutes les candidatures sont les bienvenues, sans distinction de genre ou d'origine.
Temps de travail
Temps plein
Travail le we
Non
Astreintes
Non
Déplacements
International
Critères candidat
Niveau d'années d'expérience souhaitée
3 à 5 ans
Niveau d'étude souhaité
Bac + 5
Certification ou habilitation requise
Aucune
Compétences linguistiques
- Français (C1 - Maîtrise)
- Anglais (C1 - Maîtrise)
Localisation du poste
Localisation du poste
France, Paris
Lieu
Paris 15ème - Métro Pasteur
Demandeur
Nom du responsable d'entité
MENAGER
Prénom du responsable d'entité
Hervé
Poste à pourvoir le
02/06/2025
Suivi par
Responsable principal
Nathalie SANSON
Nom
SANSON
Prénom
Nathalie
Email
nathalie.sanson@pasteur.fr
Téléphone
0176535221
